Podnebí Komor je tropické, s vysokými teplotami (průměr 30º C). Oblasti s vyšší nadmořskou výškou jsou chladnější, a to především v noci. Sezóna dešťů je od listopadu do dubna. Celoroční srážkový úhrn je 2 830 mm. Nižší teploty jsou v měsících květen až říjen ( průměr 27º C).