Na konci 16. století objevili ostrovy Evropané, koncem 19. století se staly francouzskou kolonií. V první polovině minulého století získaly statut zámořského území Francie a v roce 1974 vyhlásily nezávislost.
Ostrov Mayotte se v 90. letech minulého století osamostatnil a dobrovolně se stal opět zámořským územím Francie, ale vláda Komorských ostrovů ho stále považuje za součást státu. Občas vyhlašují samostatnost i ostatní ostrovy, situace je zde nestabilní.
Ostrovy jsou dost přelidněné. Obyvatelstvo je afrického původu, hlavními etniky jsou Ngadzija, Nzwani a Mwali. K menšinám patří Malgaši, Arabové a Evropané (hlavně Francouzi).
